ภัยพิบัติครั้งใหม่ถาโถมเข้าญี่ปุ่น เมื่อสิ่งมีชีวิตยักษ์ปริศนาโผล่ขึ้นจากอ่าวโตเกียวและค่อย ๆ กลายพันธุ์จนกลายเป็นอสูรกายมหึมา “Godzilla” ที่มีพลังทำลายล้างเหนือกว่าที่เคยมีมา การโจมตีเพียงไม่กี่ครั้งทำให้เมืองหลวงกลายเป็นซากปรักหักพัง และชีวิตผู้คนนับไม่ถ้วนต้องสังเวย รัฐบาลญี่ปุ่นต้องเผชิญกับวิกฤตชาติครั้งร้ายแรงที่สุด ระบบการตัดสินใจที่เชื่องช้าและขั้นตอนราชการที่ซับซ้อนยิ่งทำให้สถานการณ์สิ้นหวัง ขณะเดียวกันทีมผู้เชี่ยวชาญกลุ่มเล็ก ๆ ถูกจัดตั้งขึ้นเพื่อค้นหาวิธีหยุดยั้ง Godzilla ให้ได้ก่อนที่ทั้งประเทศจะล่มสลาย การต่อสู้ครั้งนี้ไม่เพียงแต่เป็นศึกเพื่อความอยู่รอดของญี่ปุ่น แต่ยังเป็นบทพิสูจน์ความกล้าหาญของมนุษยชาติในการเผชิญหน้ากับหายนะที่เกินจะควบคุมได้